廣西壯族自治區北部灣港口管理局欽州分局為廣西壯族自治區北部灣港口管理局分支機構，承擔欽州港的港口行政管理職責，主要職責如下：

一、組織編制本港域港區、作業區控制性詳細規劃以及其他相關規劃；提出本港域水運項目建設年度計劃、公益性基礎設施建設項目前期工作年度計劃和港口建設項目初步選址意見；承擔港口設施使用岸線申請材料的受理和現場核查工作。

二、具體負責港口經營許可和危險貨物作業審批及監管工作；承擔建設港口危險貨物作業場所、實施衛生除害處理專用場所以及可能危及港口安全的采掘、爆破等活動的審批工作；具體承擔港口行政執法以及引航業務和港口調度管理工作；具體負責港口安全生產、應急和港口設施保安年度核驗及監督管理工作；執行港口疏港工作任務，落實港口通關便利化相關工作；組織實施搶險、救災及突發事件等指令性運輸計劃。

三、具體實施公共航道、錨地、防波堤等公共實施的建設、養護、管理和權限范圍內的事項的許可；承擔航道行政執法工作。

四、負責水運基本建設的監督、檢查和行業管理以及行政執法工作；負責港口工程涉及安全條件、工程設計相關審核審批及驗收工作。

五、代表自治區北部灣港口管理局與地方政府進行溝通協調及上傳下達。

六、負責本港域相關統計分析工作。

七、負責本分局年度部門預算編報、財務開支、固定資產管理以及本港域港口規費征收、引航收費的監督管理；承擔本港域引航站年度部門預算初審工作。

八、負責本分局黨建、精神文明及黨風廉政建設工作；指導、監督本港域引航站的黨建、精神文明及黨風廉政建設工作。

九、負責本分局人事管理日常工作，提出本分局內設機構領導及本港域引航站領導班子調整建議意見；承擔本港域引航站公開招聘和人員調配計劃的初審工作。

十、承辦自治區北部灣港口管理局（自治區港航管理局、自治區船舶檢驗局）交辦的其他事項。